Среднее расстояние между стандартными сайтами

Значительно более точные результаты достигаются на 2-м этапе -этапе физического (рестрикционного) картирования. Среднее расстояние между стандартными сайтами узнавания на рестрикционных картах колеблется в пределах от 10 до 20 тыс. п.о. Из-за расхождений почти на два порядка масштабов цитогенетического и молекулярного картирования прямое сопоставление этих типов физических карт практически не­возможно.
Одним из способов преодоления этих трудностей является конст­руирование хромосом-специфических библиотек генов. Как уже упо­миналось (см. главу 1, 1.5), для приготовления таких библиотек ис­пользуют наборы клеточных линий соматических гибридов с отдельными хромосомами человека либо хромосомы, механически отобранные путем проточной цитометрии. Для некоторых видов молекулярного клонирования удобнее оказались библиотеки генов, построенные из субхромосомных фрагментов. Получение таких фрагментов достигается путем целенаправленного конструирования соматических гибридов, содержащих лишь часть какой-либо хромосомы человека. Суб­хромосомные клоны могут быть получены и с помощью микромани­пуляций, при которых механически, под контролем микроскопа может быть вырезан практически любой видимый фрагмент каждой хромо­сомы. Разработаны также молекулярные методы выделения из генома и идентификации крупных фрагментов ДНК, приближающихся по размерам к единичным хромосомным дискам. Это стало возможным после обнаружения редкощепящих рестриктаз, разрезающих ДНК на фрагменты длиной от сотен тысяч до миллиона пар нуклеотидов [Estivill X., Williamson R., 1987].