вторник

ВАРИАБЕЛЬНЫЕ МИКРО- И МИНИСАТЕЛЛИТНЫЕ ДНК

 

Гнпервариабельные сателлитные повторы являются гораздо более информативными маркерами по сравнению с полиморфными сайтами рестрикции, так как представляют собой мультиаллельные системы с уровнем гетерозиготности, достигающим 70-90%. Кроме того, оказа­лось, что количество высокоизменчивых микро- и минисателлитных последовательностей в геноме человека, по-видимому, превышает не­сколько десятков тысяч, они достаточно плотно и равномерно располо­жены в каждой из хромосом. Так, более 90% из 5000 идентифицирован­ных (С-А)-повторов являются полиморфными, причем в большинстве из них уровень гетерозиготности значительно превышает 50% [Weis­senbach J. et al., 1992]. Среди гипервариабельных минисателлитных по­следовательностей различают варьирующие по числу тандемные повто­ры - VNTR (variable number tandem repeats), три-, тетра- и пентануклео-тидные повторы, а также некоторые другие классы повторов. Общее число высокополиморфных минисателлитных последовательностей в геноме превышает 1500 [Armour J.L. et al., 1990; Charlesworth В. et al., 1994]. VNTR характеризуются наличием 10-15 нуклеотидных «коровых» последовательностей, сходных с контролирующими элементами реком­бинации Е. coli [Jeffreys A. J. et al., 1985]. С помощью ДНК-зонцов, сконструированных на основе тандемно повторяющихся «Кировых» по­следовательностей, можно анализировать индивидуальную изменчи­вость в единичных или множественных высокополиморфных локусах, несущих однотипную «коровую» последовательность. Примером может служить VNTR, обнаруженный в интроне миоглобинового гена, вклю­чающий четыре тандемных повтора из 33 п.о., фланкированных прямы­ми повторами из 9 п.о. Полученные из этого района ДНК-зонды с успе­хом используются для идентификации личности методом геномной дак­тилоскопии (фингерпринта), так как вероятность совпадения аллелей у двух неродственных индивидуумов по всем гипервариабельным локу-сам, гибридизующимся с этим ДНК-зондом, значительно меньше 10'7 [Jeffreys AJ. et al., 1991].