КЛАССИФИКАЦИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИХ КАРТ. ОЦЕНКА СЦЕПЛЕНИЯ

Генетические карты определяют хромосомную принадлежность и вза­имное расположение различных компонентов генома относительно друг друга. Возможность построения таких карт обусловлена двумя фундамен­тальными характеристиками генома: линейным характером локализации генов в хромосомах (это определяется линейностью молекулы ДНК) и относительной стабильностью расположения облигатных элементов гено­ма в пределах вида. При построении генетических карт используют разные подходы. В первую очередь - анализ генетического сцепления на основе определения частот мейотической рекомбинации в информативных семьях и изучение особенностей наследования признаков, сцепленных с маркерными хромосомными перестройками. Во-вторых, исследование экспрессии генов или поиск специфических последовательностей ДНК в клеточных гибридах, содержащих лишь часть генома человека - одну или несколько хромосом или их фрагменты. В ряде случаев с этой целью ис­пользуют механический отбор целых хромосом и их относительно не­больших участков. Эти приемы позволяют привязать картируемый ген к определенной хромосоме и даже к определенному ее фрагменту. С помо­щью комплекса весьма тонких методов хромосомного анализа, прежде всего методов гибридизации in situ (см. главу 1), удается картировать от­дельные гены на хромосомах человека, часто с точностью до одного дис­ка. И, наконец, методами молекулярного анализа осуществляют физиче­ское картирование последовательностей ДНК, локализованных в специ­фических участках хромосом. Затем проводят идентификацию в этих по­следовательностях транскрибируемых областей, т. е. генов, с последую­щей изоляцией и клонированием соответствующих им полноразмерных молекул кДНК. Каждый из рассмотренных этапов анализа структуры ге­нома завершается построением карт генов, различающихся по единицам измерения расстояний между отдельными элементами этих карт, масшта­бам, по насыщенности или степени детализации на различных участках генома. Соответственно различают карты сцепления, генетические кар­ты, цитогенетические карты индивидуальных хромосом и физические или молекулярные карты определенных участков ДНК. Для полной моле­кулярной идентификации отдельных элементов генома, т. е. определения их границ, структуры и нуклеотидной последовательности, необходимо совмещение всех типов карт в местах локализации этих элементов.