Идентификация в геноме человека большого числа полиморфных сайтов рестрикции и разработка простых методов анализа индивидуальной изменчивости по этим локусам существенно повысили возможности локализации неизвестных признаков на геномных картах. Уже к 1989 г. было картировано более 2000 клонированных последовательностей ДНК, обнаруживающих полиморфизм по длине рестрикционных фрагментов (ПДРФ) в различных популяциях [Kidd K.K. et al., 1989]. Более 1000 из них типировано в СЕРН-коллекциях родословных. В значительной степени это анонимные последовательности, связь которых со специфическими генами не установлена. Их наименования чаще всего соответствуют названию отобранного из библиотеки генов клона. В дальнейшем была разработана стандартная генетическая номенклатура для обозначения используемых в качестве маркеров сегментов ДНК с неизвестной функцией. Первая буква - D, что значит ДНК, затем - номер хромосомы, далее S - для уникальных и Z - для повторяющихся последовательностей, и в конце - номер, идентифицирующий данный зонд в определенном районе ДНК.
Применение полиморфных сайтов рестрикции в качестве генетических маркеров имеет два ограничения: сравнительно низкая информативность (частота гетерозигот не может превышать 50% - см. главы 2 и 5) и неравномерное распределение ПДРФ-сайтов по хромосомам. Этих недостатков практически лишены гипервариабельные STR-сайты (ди-, три- и тетрануклеатидные повторы). Использование микро- и миниса-теллитных ДНК-последовательностей в качестве индексных генетических маркеров открыло новую эру в построении карт сцепления генома человека. В настоящее время работа по идентификации высокополиморфных маркеров, перекрывающих весь геном и равномерно распределенных по хромосомам, практически завершена [Weissenbach J. et al., 1992; Reed P.W. et al., 1994]. Эта система построена на базе динуклео-тидных (С-А)п-повторов.
суббота
Идентификация числа полиморфных сайтов рестрикции
