суббота

Число индексных STR-маркеров

К 1994 г. число индексных STR-маркеров было увеличено до 2066, а средний интервал между соседними локусами уменьшен до 2,9 сМ [Gyapay G. et al., 1994]. В последнее время перспективы широкомасштабного картирования всего генома человека стали еще более значительными. Группой английских авторов под руководством ДжТодда была разработана система автоматического скринирования 254 динуклеотидных маркеров, перекрывающих весь геном человека со средним расстоянием между соседними маркерами около 13 сМ. 80% этих повторов было отобрано из Genethon-коллекции маркеров, остальные - из других источников (Genome Data Base, Baltimore). Амплификацию всех 254 полиморфных сайтов проводили в 39 мультиплексных ПЦР (МПЦР), причем используемые для этих целей оли-гопраймеры были мечены четырьмя типами флюорохромов, так что аллели даже одинаковой молекулярной массы можно было различить на электро-фореграмме по цвету. В каждой из 39 МПЦР скринировали 7-9 STR-сайтов какой-то определенной хромосомы. Такие МПЦР-наборы были разработаны для всех 22 аутосом и для Х-хромосомы. Регистрация аллелей всех STR проводилась автоматическим сканером с использованием компьютерной программы Genotyper. Только с помощью одного автоматического сканера удается проанализировать по этой схеме более 2,5 тыс. генотипов в день [Reed P.W. et al, 1994]! Такая система уже сегодня открывает самые широкие возможности не только для генетического картирования и создания подробных карт сцепления практически любых моногенных заболеваний, но, что особенно существенно, она делает реальной разработку стратегии картирования генов, мутации которых предрасполагают к мультифакториаль-ным заболеваниям, таким как диабет, гипертония, инфаркт миокарда, психозы и многое другое.