Контроль генной активности осуществляется за счет дифференциальной транскрипции и процессинга РНК в клеточных ядрах, различной стабильности мРНК в цитоплазме, избирательной трансляции мРНК. Дифференциальная экспрессия генов, конечным результатом которой является синтез функционально активного белка, предполагает не только адекватную регуляцию генной активности, но и полноценность всех последующих этапов, включая сам белковый продукт, его устойчивость, способность к посттрансляционным модификациям, правильную локализацию и корректное взаимодействие с другими компонентами клетки. Решающее значение для успешного анализа всего этого сложного комплекса имеет выбор адекватных биологических моделей, поиск и целенаправленное конструирование которых представляет вполне самостоятельную научную задачу.
Наиболее доступными модельными системами для анализа экспрессии генов in vitro являются культуры клеток. Для клонирования, генно-инженерного манипулирования, направленного введения сайт-специфических мутаций, получения большого количества клонированных последовательностей ДНК, специфических молекул мРНК, а также белкового продукта гена обычно используют генетически хорошо изученные прокариотические системы [Хеймс Б., Хиггинс С, 1987]. Дтя исследования процессов трансляции, посттрансляционных модификаций белка, его внутриклеточной локализации и функционирования чаще используют культуры клеток эукариот и, в частности, специфические культуры клеток человека. Особая роль в изучении начальных этапов развития патологического процесса, обусловленного присутствием генных мутаций, а также в разработке терапевтических методов, включая генно-инженерную коррекцию метаболического дефекта, принадлежит культурам мутантных клеток. Это могут быть первичные или перевиваемые культуры клеток, полученные из специфических тканей больного человека, либо выделенные из тканей линейных животных, служащих генетической моделью наследственного заболевания.
Идентификация гомологичных генов у экспериментальных животных во многих случаях значительно облегчает и ускоряет исследование функциональной активности нормальных и мугантных генов человека. Большая роль в изучении молекулярных механизмов развития патологических процессов in vivo принадлежит генетическим линиям животных. Это могут быть линии, полученные в результате отбора спонтанно возникших или индуцированных мутаций, а также искусственно сконструированные модели на базе трансгенных животных, в геном которых введен чужеродный ген или фрагмент ДНК. Рассмотрим основные экспериментальные подходы, используемые для анализа экспрессии генов.