Одна и та же последовательность ДНК в геноме может кодировать несколько различных белков, что достигается за счет так называемого альтернативного сплайсинга (образования разных мРНК из одного первичного РНК-транскрипта). В крупных интронах ряда генов обнаружены смысловые последовательности других генов («ген в гене»), считываемые в противоположном направлении. Транскрипционные единицы генома могут перекрываться за счет наличия разных промоторов. Наконец, благодаря сома!ической рекомбинации структура транскрибируемых последовательностей некоторых генов может быть различной в разных клонах клеток одного организма (Т-клеточные рецепторы). Ситуация с определением понятия «ген» еше больше осложняется, если в это понятие включать многочисленные регулятор-ные последовательности. Возникает вопрос: «Как далеко от гена могут располагаться эти последовательности, чтобы их можно было включать в структуру гена?». Для многих целей оказывается удобным введенное в последнее время понятие «считаемый ген» - counting gene. Последний рассматривается как отдельная транскрибируемая единица ДНК или ее часть, которая может транслироваться в одну или несколько взаимосвязанных аминокислотных последовательностей. Поэтому последовательность, дающая две транскрипционные единицы за счет альтернативного сплайсинга и, как следствие, два разных белка, учитывается как один ген. Однако, если степень гомологии двух гено-продуктов, имеющих общий транскрибируемый участок, невелика, то эти последовательности расцениваются ка:с два разных гена [Fields Ch. etal.,1994].