суббота

Частота коротких тандемных повторов

Высокая частота коротких тандемных повторов, уникальность ком­бинаций числа тетра-, три- и димеров в разных сайтах в сочетании с их большой вариабельностью и сравнительной легкостью идентификации аллелей позволяет широко использовать эти повторы для генетического и физического картирования в качестве наиболее удобных индексных маркеров геномных ДНК-последовательностей (см. главу 3). Такие мар­керные сайты получили название STS (sequence tagged sites). В настоя­щее время в геноме человека уже идентифицировано около 10000 STS, подавляющее большинство которых представляет собой тандемные по­вторы 2-4 нуклеотидов. Благодаря выраженной индивидуальной специ­фичности и достаточно стабильному менделевскому типу наследования STS-сайты нашли широкое применение и в молекулярной диагностике генных болезней, прежде всего в качестве молекулярных маркеров для идентификации мутантных хромосом в семьях высокого риска (см. главу 7). Наличие большого числа гипервариабельных микро- и минисател-литных последовательностей ДНК является характерной особенностью генома человека. Аналогичные последовательности, обнаруженные в геноме приматов, значительно более однородны, что доказывает воз­можность существенного увеличения вариабельности этих участков ДНК за сравнительно короткий эволюционный промежуток [Юров Ю.Б., 1987; Gray I.C. et al., 1991].
Сведения о мутабильности высокополиморфных последовательностей в геноме человека весьма противоречивы. Показано, однако, что в наиболее вариабельных минисателлитных локусах частота мутаций мо­жет достигать 5% на гамету [Jeffreys A.J. et al., 1988]. Предполагается, что одной из главных функций гипервариабельных микро- и минисател­литных последовательностей ДНК может быть контроль гомологичной рекомбинации в мейозе. На культурах клеток показано стимулирующее влияние минисателлитных последовательностей ДНК на гомологичную рекомбинацию. Так, инсерция синтезированной последовательности, составленной на основе гипервариабельных минисателлитов, в геномную ДНК приводит к более чем 10-кратному увеличению числа реци-прокных обменов, причем степень этого влияния обратно пропорциональна расстоянию между STR и сайтом рекомбинации [Wahls W.P. et al., 1990]. Вместе с тем многие авторы обращают внимание на достаточно высокую стабильность минисателлитных аллелей, что позволяет их широко использовать как для генетического маркирования, так и для попу-ляционных исследований и идентификации личности методом геномной дактилоскопии [Иванов П.Л., 1989; Edwards A. et al.,1991; Decorte R., Cassiman J.J., 1993].