Особое место среди сателлитных ДНК занимают микро- и миниса-теллитные последовательности, представляющие собой многочисленную группу рассеянных по всему геному относительно коротких тан-демных повторов. Микросателлиты - это класс динуклеотидных повторов. Размер повторяющихся единиц в минисателлитных последовательностях может меняться от 3-4 до 10-15 нуклеотидов. Отличительной особенностью микро- и минисателлитов является наличие среди них большого количества участков, вариабельных по числу копий в кластере.
Инвертированные, или обращенные, повторы составляют до 5% генома. Они состоят из двух тождественных копий длиной около 300 п.о., ориентированных в противоположных направлениях на одной нити ДНК и лежащих на расстоянии от нуля до десятка тысяч пар нуклеотидов друг от друга (в среднем 1,6 тыс. п.о.). Около 73 обращенных повторов не разделены промежуточными последовательностями и носят название палиндромов. Среднее расстояние между двумя различными парами инвертированных повторов около 12 тыс. п.о., и их распределение по геному носит случайный характер. Комплементарные пары легко ассоциируют при отжиге, образуя шпилечные структуры с дуплексной ножкой и однонитевой петлей, длина которой соответствует расстоянию между парой обращенных повторов. Вследствие этого оказываются приближенными достаточно удаленные друг от друга участки ДНК, что важно для работы ряда ферментов, обеспечивающих процессы репликации и транскрипции. Важно отметить и то, что однонитевой участок ДНК, образующий петлю, становится доступным для действия нуклеазы S1, специфически разрушающей однонитевую ДНК.
